Las antocianinas son pigmentos naturales y antioxidantes de interés en la industria alimentaria, farmacéutica y cosmética. En el presente trabajo se implementó un proceso de purificación preliminar de antocianinas de maíz azul (Zea mays). El avance del proceso de purificación fue analizado en términos del contenido total de antocianinas (TAC), carbono orgánico total (TOC) y Cromatografía Líquida de Alta Resolución (HPLC) fase reversa. Para el pre-tratamiento de los extractos se uso microfiltración y ultrafiltración. La purificación de antocianinas se realizó mediante adsorción y electroforesis. La adsorción se realizó usando una resina polimérica estireno-divinilbenceno (SP-207), los resultados fueron correlacionados usando los modelos de Freundlich y Langmuir. Las mejores condiciones de purificación de antocianinas en electroforesis fueron a pH 3 y 220 V. El proceso de purificación fue mejorado usando electroforesis resultando una disminución de TOC de 59.52 ± 0.53 mg a 3.966 ± 0.257 mg por miligramo de antocianinas. El proceso implementado fue exitosamente usado en col morada (Brassica oleracea var. Capitata) y arándanos (Vaccinium corymbosum). En conclusión, el proceso propuesto puede ser utilizado como un proceso de purificación preliminar de antocianinas en diferentes fuentes.